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廣泛代謝組實驗樣本前處理標準操作流程

發布日期: 2026-03-13
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   廣泛代謝組實驗的核心目標是全面捕獲生物樣本中的代謝物信息,而樣本前處理作為實驗的關鍵環節,直接決定代謝物提取效率、檢測準確性及實驗重復性??茖W規范的前處理流程可最大限度減少干擾、保留代謝物多樣性,為后續色譜-質譜檢測奠定基礎,現結合各類常見樣本特性,制定統一標準操作流程。
 
  樣本準備是前處理的前提,核心在于避免污染與代謝物降解。采集樣本時需遵循快速、低溫原則,所有操作盡量在冰上進行,避免樣本長時間暴露于室溫。不同類型樣本需針對性處理:細胞樣本需用預冷PBS清洗2-3次去除培養基殘留,離心收集后液氮速凍;組織樣本需快速去除血液、雜質,按250mg/管分裝后液氮冷凍;體液樣本中,血清需室溫靜置凝固后離心,尿液需離心去除沉淀,唾液需禁食1小時后采集并過濾除菌。所有樣本需做好清晰標記,分裝后置于-80℃保存,嚴禁反復凍融。
 
  樣本破碎與勻漿旨在打破生物壁壘,釋放胞內代謝物。冷凍樣本需在低溫環境下解凍,避免代謝物變性。組織樣本采用液氮研磨或組織勻漿法,加入預冷提取溶劑后充分研磨至勻漿狀態;細胞樣本可直接加入提取溶劑,渦旋震蕩使細胞裂解。破碎過程中需全程低溫,所用器械需經滅菌處理,避免交叉污染,同時避免使用含染料的耗材及保鮮膜,防止PEG等雜質干擾檢測。
 
  代謝物提取是核心步驟,需根據代謝物極性選擇合適溶劑體系。常用提取溶劑包括甲醇、乙腈等,極性代謝物可選用甲醇-水混合體系,脂類代謝物可選用氯仿-甲醇體系,溶劑與樣本體積比控制在3:1至10:1之間。提取時加入內標物以校正提取效率,渦旋震蕩1-10分鐘后,4℃下12000-15000g離心10-20分鐘,收集上清液,沉淀可重復提取一次以提高回收率,合并兩次上清液備用。
 
  凈化與濃縮用于去除雜質,提高檢測靈敏度。上清液可通過0.22μm濾膜過濾,去除蛋白質、細胞碎片等大分子雜質;若樣本雜質較多,可采用固相萃取法進一步凈化。凈化后的樣本采用氮吹或真空濃縮法濃縮,避免高溫導致代謝物降解,濃縮至合適體積后,用提取溶劑定容,渦旋混勻后再次離心,確保樣本澄清。
 
  樣本保存與質控是實驗可靠性的保障。處理后的樣本需分裝至無菌離心管,做好標記后置于-80℃保存,待檢測時快速解凍并立即上機。同時,需制備質控樣本,混合所有樣本等量上清液,按相同流程處理,用于監控前處理及檢測全過程的穩定性。整個操作過程需嚴格遵循無菌原則,所用試劑均為色譜級,溶液現配現用,確保實驗重復性與結果準確性。
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